RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR56B1Q8NGI3 324 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR52J3Q8NH60 311 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAMD8Q96LT4 415 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4F4Q96R69 305 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM9Q9C026 710 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALG9Q9H6U8 611 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR83Q9NYM4 423 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 RSPH14Q9UHP6 348 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDCQ9Y266 331 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGRNO00468 2067 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCC9O60706 1549 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFCAB7A8K855 629 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf98E9PRG8 122 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BMH7 237 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASGRF2O14827 1237 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 STK17BO94768 372 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAMEF12O95522 483 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV3-9P01782 118 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNT2P09544 360 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCCHC18P0CG32 403 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PVRP15151 417 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRDX2P32119 198 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 RABIFP47224 123 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAG2P55895 527 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERVK_113P63132 956 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERVK-8P63133 956 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL9RQ01113 521 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF33BQ06732 778 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEX6Q13608 980 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDIA5Q14554 519 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZIC1Q15915 447 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MICAQ29983 383 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRIT3Q3SXY7 679 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATAD3CQ5T2N8 411 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF600Q6ZNG1 722 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM26Q6ZUK4 368 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAQR9Q6ZVX9 377 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS48Q7RTY5 328 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAXDQ8IW45 347 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPD1LQ8N335 351 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF148Q8N7C7 305 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFESDQ8TAC1 157 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCGR1BQ92637 280 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC51Q96ER9 411 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 C14orf79Q96F83 325 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM111AQ96PZ2 611 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 CARD6Q9BX69 1037 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERVK-6Q9BXR3 956 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT23Q9C075 422 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB17Q9H0T7 212 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf21Q9H246 121 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IMPAD1Q9NX62 359 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GDAP2Q9NXN4 497 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NINJ2Q9NZG7 142 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCD2Q9UBJ2 740 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRODH2Q9UF12 536 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NTNG1Q9Y2I2 539 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHRS7Q9Y394 339 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPRASP1Q5JY77 1395 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPRUQ92729 1446 aa2.08□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPIPA2E9PIF3 369 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDLIM1O00151 329 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 LGALS8O00214 317 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAP18O00422 153 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 TYROBPO43914 113 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPSAP2O60256 369 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDC3O75056 442 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAM2O75886 525 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFA7O95182 113 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGSF6O95976 241 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 THY1P04216 161 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC35G4P0C7Q5 338 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGFBP5P24593 272 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPN4P29074 926 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEA9P43362 315 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASMTP46597 345 aa2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms