RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 AMZ1Q400G9 498 aa16.72■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 DCST1Q5T197 706 aa16.7■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 CTPS2Q9NRF8 586 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ARRDC5A6NEK1 342 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 OR10H2O60403 315 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ABCB7O75027 752 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ALOX5P09917 674 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 GGT2P36268 569 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.69■□□□□ 0.26
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