RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 HIKESHIQ53FT3 197 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 EOGTQ5NDL2 527 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CPOQ8IVL8 374 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 LRRC46Q96FV0 321 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAHD2AQ96GK7 314 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 IGSF21Q96ID5 467 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CPNE1Q99829 537 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TSSK1BQ9BXA7 367 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BEX2Q9BXY8 128 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NUAK2Q9H093 628 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PCBD2Q9H0N5 130 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DECR2Q9NUI1 292 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PARPBPQ9NWS1 579 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CXorf65A6NEN9 183 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MOXD2PA6NHM9 499 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 A6NIZ1 184 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NRP1O14786 923 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 APOC3P02656 99 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 C1SP09871 688 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FCGR1AP12314 374 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MGAT1P26572 445 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ELK3P41970 407 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DAOAP59103 153 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TPI1P60174 286 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OVGP1Q12889 678 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SCGB2A2Q13296 93 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TCEA2Q15560 299 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PROX2Q3B8N5 592 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MSS51Q4VC12 460 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 COQ5Q5HYK3 327 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 VWA1Q6PCB0 445 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ULK3Q6PHR2 472 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 QSOX2Q6ZRP7 698 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SLC22A15Q8IZD6 547 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OFCC1Q8IZS5 231 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF276Q8N554 614 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OR4K15Q8NH41 348 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SLC39A7Q92504 469 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TM4SF18Q96CE8 201 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 APOLD1Q96LR9 279 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 AMDHD1Q96NU7 426 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RBP7Q96R05 134 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 WDCPQ9H6R7 721 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PIGVQ9NUD9 493 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FZD10Q9ULW2 581 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1W2PPE2 198 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1W2PR64 198 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KCNU1A8MYU2 1149 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 E7ESA3 106 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 H3BQ06 376 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CHST10O43529 356 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TYROBPO43914 113 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MFSD11O43934 449 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HCN1O60741 890 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 LALBAP00709 142 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 INHAP05111 366 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CRYBA1P05813 215 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MELTFP08582 738 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PEPDP12955 493 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HTR1BP28222 390 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 GCGRP47871 477 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 IL5RAQ01344 420 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms