RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SLC35A4Q96G79 324 aa20.39■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 MSANTD3Q96H12 275 aa20.39■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 PLEKHA8Q96JA3 519 aa20.39■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.39■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 PALMDQ9NP74 551 aa20.39■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 A0A0J9YY10 115 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 EFCAB9A8MZ26 197 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 LSSP48449 732 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CDC73Q6P1J9 531 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 C16orf87Q6PH81 154 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 USP53Q70EK8 1073 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 IQCHQ86VS3 1027 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 VRK2Q86Y07 508 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 OR4N5Q8IXE1 308 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 MORN4Q8NDC4 146 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 VMP1Q96GC9 406 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGDIGQ99819 225 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CDCA4Q9BXL8 241 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 LYRM4Q9HD34 91 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJB6O75190 326 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 PIPP12273 146 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 PVRP15151 417 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 MMP11P24347 488 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 C1orf94Q6P1W5 598 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 OR2L13Q8N349 312 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ZG16BQ96DA0 208 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CTPS2Q9NRF8 586 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 PTGFRNQ9P2B2 879 aa20.38■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 LRP4O75096 1905 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ENTPD6O75354 484 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 PTHP01270 115 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 TP53P04637 393 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 THEGLP0DJG4 465 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CPMP14384 443 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 TNNI3P19429 210 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 PRKAR1BP31321 381 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CLK1P49759 484 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 TAS2R41P59536 307 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 OLR1P78380 273 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 INAVAQ3KP66 663 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 MANEAQ5SRI9 462 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 Q6ZS52 159 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 RNF44Q7L0R7 432 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ADCK1Q86TW2 530 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 GJD3Q8N144 294 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 FRMD1Q8N878 549 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SLC16A11Q8NCK7 471 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SLC25A19Q9HC21 320 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SPACA6W5XKT8 324 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.37■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 AIREO43918 545 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CTSEP14091 401 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 PORP16435 677 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 OPRL1P41146 370 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SLC15A1P46059 708 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 PDX1P52945 283 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF367Q7RTV3 350 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF860A6NHJ4 632 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 J3QRK9 145 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 FCMRO60667 390 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 TMED1Q13445 227 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 FZD2Q14332 565 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 OR52P1PQ8NH57 321 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 SLC9A6Q92581 669 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CDS1Q92903 461 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM74BQ9NUR3 256 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CORINQ9Y5Q5 1042 aa20.36■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 GSTM3P21266 225 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 IFNA8P32881 189 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ARMCX4Q5H9R4 360 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 GPR174Q9BXC1 333 aa20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPHK1-201ENST00000323374 CLDN25C9JDP6 229 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms