RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 C16orf52Q8NHV5 167 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAL2Q969L2 176 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCLNQ969V3 563 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 NACC2Q96BF6 587 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRGUKQ96M69 825 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM15Q9C019 465 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 A4GALTQ9NPC4 353 aa25.51■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa25.51■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FIG4Q92562 907 aa25.5■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C16orf62Q7Z3J2 963 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB43Q86YS6 212 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF321PQ8N8H1 164 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 VMP1Q96GC9 406 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 MESP1Q9BRJ9 268 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCNM1Q9BWG6 230 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP22Q9NRW4 184 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTR3BQ9P1U1 418 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIPT1Q9Y234 373 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANGPT4Q9Y264 503 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXCR6O00574 342 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARPC2O15144 300 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC28A2O43868 658 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLPSP04118 112 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACP2P11117 423 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 GGT1P19440 569 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABRA3P34903 492 aa25.48■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MYBPC3Q14896 1274 aa25.48■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35A4Q96G79 324 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSTM2LQ96N03 204 aa25.48■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BCHEP06276 602 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC26A5P58743 744 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D25Q3MII6 688 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFAF7Q7L592 441 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM162AQ96A26 154 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SOCS6O14544 535 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACOT8O14734 319 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GPAT3Q53EU6 434 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 REEP3Q6NUK4 255 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR11G2Q8NGC1 345 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC38A5Q8WUX1 472 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 NSMCE2Q96MF7 247 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITPAQ9BY32 194 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q9N2J8 555 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 CALML5Q9NZT1 146 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 PEX12O00623 359 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 CREG1O75629 220 aa25.46■■□□□ 1.67
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