RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 COL6A6A6NMZ7 2263 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 RFXANKO14593 260 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CD1EP15812 388 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 DRD5P21918 477 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 TNFSF10P50591 281 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 NFATC3Q12968 1075 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 OR1C1Q15619 314 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SPINK14Q6IE38 97 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 GK5Q6ZS86 529 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 PRR22Q8IZ63 422 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SLC15A4Q8N697 577 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 OR56A1Q8NGH5 318 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO30Q8TB52 745 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SFXN5Q8TD22 340 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 MOAP1Q96BY2 351 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 BTBD9Q96Q07 612 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM4Q9C037 500 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SAR1AQ9NR31 198 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 FRG2CA6NGY1 282 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 GSNP06396 782 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CT45A8P0DMV1 189 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CT45A9P0DMV2 189 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CDKN2CP42773 168 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 PSG6Q00889 435 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 KLRB1Q12918 225 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 TLR1Q15399 786 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CT45A2Q5DJT8 189 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 COLEC12Q5KU26 742 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 C6orf10Q5SRN2 563 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 HORMAD2Q8N7B1 307 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SLC9A6Q92581 669 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 JADE3Q92613 823 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 GIMAP5Q96F15 307 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 C16orf58Q96GQ5 468 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 ITCHQ96J02 903 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 MRGBPQ9NV56 204 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CDK2AP1O14519 115 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 ACOX3O15254 700 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 ANP32DO95626 131 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN3P20807 821 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 UQCRC2P22695 453 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 ABCD3P28288 659 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 GAB1Q13480 694 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SLC6A19Q695T7 634 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 MFSD12Q6NUT3 480 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 BHLHB9Q6PI77 547 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SLC2A7Q6PXP3 512 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 Q6ZS92 163 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF621Q6ZSS3 439 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CDRT4Q8N9R6 151 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SERHLQ9NQF3 203 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 LUZP4Q9P127 313 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 VPS4AQ9UN37 437 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 NINQ8N4C6 2090 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 NEURL1O76050 574 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 PRIM2P49643 509 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 PLCXD2Q0VAA5 305 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 MDS2Q8NDY4 140 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 OR5M3Q8NGP4 307 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 Q9N2J8 555 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC22O60826 627 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A12O75746 678 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 GABRA3P34903 492 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 KLF10Q13118 480 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms