RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 SYPL1Q16563 259 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PIK3R3Q92569 461 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ENTPD4Q9Y227 616 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ENPP4Q9Y6X5 453 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR6C74A6NCV1 312 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 FAM20BO75063 409 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 DBTP11182 482 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 UBL4AP11441 157 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ETV6P41212 452 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 ASPGQ86U10 573 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR9Q2Q8NGE9 314 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 UBE2FQ969M7 185 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 OR2A14Q96R47 310 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.21■□□□□ 0.83
MESP1-201ENST00000300057 PCDH17O14917 1159 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TRAPPC2P0DI81 140 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TRAPPC2BP0DI82 140 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 UGT2B7P16662 529 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 KIR2DS3Q14952 304 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 MICAQ29983 383 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 OLIG3Q7RTU3 272 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 KBTBD8Q8NFY9 601 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 LRP4O75096 1905 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 PRKACBP22694 351 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 RGS1Q08116 209 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 YIF1BQ5BJH7 314 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TMEM107Q6UX40 140 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 CCDC32Q9BV29 185 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 GABARAPL3Q9BY60 117 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 ACER3Q9NUN7 267 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.2■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TRIOO75962 3097 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 GADD45GO95257 159 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 VIPP01282 170 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 LCKP06239 509 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 YES1P07947 543 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 CTSKP43235 329 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 RABIFP47224 123 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TGM3Q08188 693 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 SLC48A1Q6P1K1 146 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 COL21A1Q96P44 957 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 RNF6Q9Y252 685 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 BOLA1Q9Y3E2 137 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 PROM1O43490 865 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 CTSVO60911 334 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 PDE9AO76083 593 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 TNFP01375 233 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 NR2F1P10589 423 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 ARFIP1P53367 373 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 LIM2P55344 173 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 GPR50Q13585 617 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 ZNF605Q86T29 641 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 CCDC28AQ8IWP9 274 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 SETD6Q8TBK2 473 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 GAL3ST3Q96A11 431 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 PITX2Q99697 317 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 RHNO1Q9BSD3 238 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 CES1P1Q9UKY3 287 aa20.19■□□□□ 0.82
MESP1-201ENST00000300057 DSCR3O14972 297 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms