RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298130.4

SPTSSA-201, Transcript of serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTSSA, Length 2,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSA-201ENST00000298130 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.95■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 ART5Q96L15 291 aa22.95■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 A0A0B4J293 547 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 TTC36A6NLP5 189 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 FAM170BA6NMN3 283 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 VEGFDO43915 354 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 SLC2A10O95528 541 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 NR2F6P10588 404 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.264e-6■■■■□ 24.4
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SPTSSA-201ENST00000298130 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 BBS1Q8NFJ9 593 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 KAT2AQ92830 837 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 A0A1W2PR48 441 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 CPEP16870 476 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 CXCR2P25025 360 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 MAN2A2P49641 1150 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 DPTQ07507 201 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 P2RY14Q15391 338 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 SIMC1Q8NDZ2 872 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 KCTD7Q96MP8 289 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.94■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 LRIT2A6NDA9 550 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 CENPXA8MT69 81 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 LGI1O95970 557 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 BCL6P41182 706 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 IL12RB1P42701 662 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 DMPKQ09013 629 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 LTB4RQ15722 352 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 METRNLQ641Q3 311 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 TMEM245Q9H330 911 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 A0A0A6YYD5 115 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa22.93■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 CERS1P27544 350 aa22.93■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 MTNR1AP48039 350 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 SMIM11AP58511 58 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 C1orf94Q6P1W5 598 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 FAM92BQ6ZTR7 304 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 NKAIN4Q8IVV8 208 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 ANKK1Q8NFD2 765 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 TEX47Q8TBZ9 253 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 PELI2Q9HAT8 420 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 DEC1Q9P2X7 70 aa22.93■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 FAM183AA6NL82 134 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 CASKO14936 926 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 FCMRO60667 390 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 HPGDSO60760 199 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 MC3RP41968 323 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 SMSP52788 366 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 ZNF311Q5JNZ3 666 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 ZNF730Q6ZMV8 503 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 SUN3Q8TAQ9 357 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 RASSF5Q8WWW0 418 aa22.92■■□□□ 1.26
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SPTSSA-201ENST00000298130 CCDC182A6NF36 153 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 PLA2G10O15496 165 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 LIMS3P0CW19 117 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 LIMS4P0CW20 117 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 TAS2R38P59533 333 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 GALNT12Q8IXK2 581 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 PRRC1Q96M27 445 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 DEPDC7Q96QD5 511 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa22.92■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.91■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 CD8B2A6NJW9 211 aa22.91■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 CD8BP10966 210 aa22.91■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 SOX9P48436 509 aa22.91■■□□□ 1.26
SPTSSA-201ENST00000298130 SLC27A4Q6P1M0 643 aa22.91■■□□□ 1.26
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