RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292408.8

FGFR4-201, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGFR4, Length 3,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-201ENST00000292408 CCDC116Q8IYX3 515 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 SLC37A3Q8NCC5 494 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 NEIL3Q8TAT5 605 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 MED20Q9H944 212 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 WASH3PC4AMC7 463 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 HOXA2O43364 376 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 LANCL1O43813 399 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 IL1AP01583 271 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 OR8H1Q8NGG4 311 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 BBS10Q8TAM1 723 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 MAPRE3Q9UPY8 281 aa15.48■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 SPEGQ15772 3267 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 PITPNM1O00562 1244 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 RB1P06400 928 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 C8AP07357 584 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 GNSP15586 552 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 SRP9P49458 86 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 FAM205BPQ63HN1 556 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 LRRTM4Q86VH4 590 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 QRFPRQ96P65 431 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF607Q96SK3 696 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 ACOXLQ9NUZ1 547 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 LIMS3P0CW19 117 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 LIMS4P0CW20 117 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 DDCP20711 480 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 TAS2R41P59536 307 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 SRP54P61011 504 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 RAB33AQ14088 237 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 PLK5Q496M5 336 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 GDPD1Q8N9F7 314 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 NEURL3Q96EH8 262 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF558Q96NG5 402 aa15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 A0A087WUU8 490 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 FAM170BA6NMN3 283 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 CPEP16870 476 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 SYN1P17600 705 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 IRS1P35568 1242 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 RPS5P46782 204 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.074e-9■□□□□ 11.1
FGFR4-201ENST00000292408 CDH11P55287 796 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 TEAD2Q15562 447 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 GRPEL2Q8TAA5 225 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 CXorf40BQ96DE9 158 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 CCDC120Q96HB5 630 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 GDF15Q99988 308 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF222Q9UK12 451 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 MYO9BQ13459 2157 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 SNTNA6NMZ2 147 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 OLFM2O95897 454 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 INHAP05111 366 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF30P17039 623 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 NNMTP40261 264 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 TEKQ02763 1124 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 BCL2L15Q5TBC7 163 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 LHX8Q68G74 356 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 VRK2Q86Y07 508 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 BEST4Q8NFU0 473 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 OR51G2Q8NGK0 314 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 MSLNLQ96KJ4 702 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 SLC35G5Q96KT7 338 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 WDFY2Q96P53 400 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.46■□□□□ 0.07
FGFR4-201ENST00000292408 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.46■□□□□ 0.06
FGFR4-201ENST00000292408 SOCS6O14544 535 aa15.46■□□□□ 0.06
FGFR4-201ENST00000292408 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
FGFR4-201ENST00000292408 LATS1O95835 1130 aa15.46■□□□□ 0.06
FGFR4-201ENST00000292408 EPPINO95925 133 aa15.46■□□□□ 0.06
FGFR4-201ENST00000292408 CHRM4P08173 479 aa15.46■□□□□ 0.06
FGFR4-201ENST00000292408 PRKAR1AP10644 381 aa15.46■□□□□ 0.06
FGFR4-201ENST00000292408 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms