RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LAS2Q8IYD9 372 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PARP8Q8N3A8 854 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SMYD1Q8NB12 490 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFP90Q8TF47 636 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NUS1Q96E22 293 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TPD52L3Q96J77 140 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 COQ10AQ96MF6 247 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PITX2Q99697 317 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 AKAP9Q99996 3911 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SGPP1Q9BX95 441 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NLNQ9BYT8 704 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DUSP21Q9H596 190 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PELI2Q9HAT8 420 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNT8Q9NY28 637 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1A2Q9Y585 309 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GABRR3A8MPY1 467 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C5orf58C9J3I9 102 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN25C9JDP6 229 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KDM1AO60341 852 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TBX19O60806 448 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MTX2O75431 263 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA3DO95025 777 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC16A8O95907 504 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MATN1P21941 496 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKACGP22612 351 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 UQCRC2P22695 453 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 F8A1P23610 371 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RRM2P31350 389 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CSF2RBP32927 897 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGAP37287 484 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEA8P43361 318 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PREPP48147 710 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DAPP51397 102 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 BLKP51451 505 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CTSCP53634 463 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TBPL1P62380 186 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 YPEL5P62699 121 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SELENOWP63302 87 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DPTQ07507 201 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RAPSNQ13702 412 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SCARB2Q14108 478 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RGS21Q2M5E4 152 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 HKDC1Q2TB90 917 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FGD3Q5JSP0 725 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 XAF1Q6GPH4 301 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FAHD1Q6P587 224 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL35Q6PF15 583 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZNX1 250 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.62□□□□□ -1.35
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