RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 CD68P34810 354 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 XCR1P46094 333 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CES4AQ5XG92 561 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FAM174AQ8TBP5 190 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 BMFQ96LC9 184 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GAREM1Q9H706 876 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NANSQ9NR45 359 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TAAR2Q9P1P5 351 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SEC14L4Q9UDX3 406 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 HTR3EA5X5Y0 456 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 HTR1AP08908 422 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 YPEL5P62699 121 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 KCTD9Q7L273 389 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 COMMD6Q7Z4G1 85 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SERINC2Q96SA4 455 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PBX4Q9BYU1 374 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 A0A096LPI6 279 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 WASH4PA8MWX3 477 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 F11P03951 625 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CD97P48960 835 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 E2F1Q01094 437 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 OR4D1Q15615 310 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SLC22A12Q96S37 553 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FBXL3Q9UKT7 428 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MGAT4BQ9UQ53 548 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MAP2K3P46734 347 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CTSCP53634 463 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 LAPTM4AQ15012 233 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 UGT3A2Q3SY77 523 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SLC25A25Q6KCM7 469 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TMEM80Q96HE8 168 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 A0A1B0GVC2 190 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 E7ESA3 106 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TOXO94900 526 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 HTR2AP28223 471 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 HOXA9P31269 272 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MARVELD2Q8N4S9 558 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 METTL25Q8N6Q8 603 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TIMM29Q9BSF4 260 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ABCD2Q9UBJ2 740 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RGPD5Q99666 1765 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SLC35F4A4IF30 521 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 C17orf105B2RV13 164 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RRP8O43159 456 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PVRP15151 417 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GGT2P36268 569 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GALK2Q01415 458 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 LRIT3Q3SXY7 679 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RAB41Q5JT25 222 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 BIRC8Q96P09 236 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 DOHHQ9BU89 302 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 STARD5Q9NSY2 213 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SH2B3Q9UQQ2 575 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 KNTC1P50748 2209 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GJE1A6NN92 205 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 LRRN3E7EW58 273 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MT-ND5P03915 603 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GRB7Q14451 532 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CREB3L4Q8TEY5 395 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TSPEARQ8WU66 669 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ITPKCQ96DU7 683 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 BORCS8Q96FH0 119 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 LRRN3Q9H3W5 708 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PRSS16Q9NQE7 514 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GSKIPQ9P0R6 139 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 EXTL2Q9UBQ6 330 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 APC2O95996 2303 aa13.1□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TUBG1P23258 451 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RBPJQ06330 500 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PARM1Q6UWI2 310 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RELL1Q8IUW5 271 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 HOXD1Q9GZZ0 328 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TM9SF3Q9HD45 589 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 F5H0A9 414 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SGK494L7N484 410 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NUAK1O60285 661 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SNAP29O95721 258 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 S1PR1P21453 382 aa13.09□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CERS1P27544 350 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms