RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MITFO75030 526 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJB5O75953 348 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PRKAR1AP10644 381 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 AVPR1BP47901 424 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 KCNJ5P48544 419 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ARFIP1P53367 373 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CD47Q08722 323 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 FGL2Q14314 439 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 FAM214AQ32MH5 1076 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 KCT2Q8NC54 265 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SMRP1Q8NCR6 262 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GAL3ST4Q96RP7 486 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 COPS4Q9BT78 406 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 UCK2Q9BZX2 261 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RERGLQ9H628 205 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ABI3Q9P2A4 366 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ROS1P08922 2347 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM221A6NGB7 291 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 M0R296 226 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 UGT2B7P16662 529 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RYKP34925 604 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CLK3P49761 638 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 COX10Q12887 443 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC13A2Q13183 592 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DGUOKQ16854 277 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC28AQ8IWP9 274 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 HORMAD2Q8N7B1 307 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OR13H1Q8NG92 308 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PMM1Q92871 262 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MS4A6EQ96DS6 147 aa10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF462Q96JM2 2506 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CROCCQ5TZA2 2017 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1B0GVT2 93 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 FAAHO00519 579 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GFRA3O60609 400 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TBX19O60806 448 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 AIFM1O95831 613 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TNFRSF1BP20333 461 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TPTEP56180 551 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CARTPTQ16568 116 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MICAQ29983 383 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PIGXQ8TBF5 258 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SPHK1Q9NYA1 384 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MTCH2Q9Y6C9 303 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF860A6NHJ4 632 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC1A7O00341 560 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TSC22D2O75157 780 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SMIM18P0DKX4 95 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SRFP11831 508 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GABRG2P18507 467 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GSTM3P21266 225 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC19A1P41440 591 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 YBX1P67809 324 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PPP2R2BQ00005 443 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CRB2Q5IJ48 1285 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 LINC01555Q8NAE3 123 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC20Q8TCA0 184 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GPR151Q8TDV0 419 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 A4GALTQ9NPC4 353 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLAMF7Q9NQ25 335 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 FASNP49327 2511 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMPRSS11DO60235 418 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SCN2BO60939 215 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ADAM23O75077 832 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MYL12AP19105 171 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC14A1Q13336 389 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GPR18Q14330 331 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CNIH3Q8TBE1 160 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SMPDL3BQ92485 455 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 KAT2AQ92830 837 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RHCGQ9UBD6 479 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 IFT52Q9Y366 437 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 WDR45Q9Y484 360 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa10.01□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PQF6 199 aa10□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DCDC2BA2VCK2 349 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms