RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ncbp2Q9CQ49 156 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CenpvQ9CXS4 252 aa19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9D4W2 315 aa19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cib4Q9D9N5 185 aa19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prl8a8Q9DAS4 241 aa19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lmx1aQ9JKU8 382 aa19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cldn6Q9Z262 219 aa19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5072A2AHM1 344 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp59P16373 634 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptpn22P29352 802 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Efna1P52793 205 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nr2f1Q60632 422 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdkn2dQ60773 166 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Laptm4aQ60961 233 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp3r2Q63811 179 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lpcat4Q6NVG1 524 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TiprlQ8BH58 271 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxo9Q8BK06 437 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C1raQ8CG16 707 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Steap3Q8CI59 488 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpini2Q9JK88 405 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bex2Q9WTZ8 129 aa19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppt2O35448 302 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdc25bP30306 576 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SgcdP82347 289 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sox14Q04892 240 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trappc13Q3TIR1 417 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pnliprp1Q5BKQ4 473 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PfplQ5RKV8 702 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam169aQ5XG69 665 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nipal3Q8BGN5 410 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PxkQ8BX57 582 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hat1Q8BY71 416 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lats1Q8BYR2 1129 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf322Q8BZ89 410 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rdh1Q8CGV4 317 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 As3mtQ91WU5 376 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asb8Q91ZT9 288 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700034I23RikQ9D9Q3 184 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr938Q9EQ93 315 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Szt2A2A9C3 3431 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm9573F7C950 1606 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd300ld4A2A7W1 245 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SrsxB2RZI1 361 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rdh8D3Z6W3 317 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdk5r2O35926 369 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ulk1O70405 1051 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CtslP06797 334 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mc3rP33033 323 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AboP38649 332 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc44a5Q5RJI2 710 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TifaQ793I8 184 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itih5Q8BJD1 952 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smyd4Q8BTK5 799 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eri3Q8C460 337 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc22a12Q8CFZ5 553 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fndc5Q8K4Z2 209 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd276Q8VE98 316 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q91W34 466 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhdc8aQ91XA8 350 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hcar2Q9EP66 360 aa19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf39A2RT81 352 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10799F7C7U2 104 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r16K7N775 303 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bmp4P21275 408 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ffar3Q3UFD7 319 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf513Q6PD29 541 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf770Q8BIQ8 705 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a24Q8BMD8 475 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NarsQ8BP47 559 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1390Q8VGW9 311 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Timm22Q9CQ85 194 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc52a3Q9D6X5 460 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tpk1Q9R0M5 243 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mgl2A9XX86 381 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sult2a6B2RVI8 285 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr543E9PWI5 336 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr209L7N1X3 305 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 UoxP25688 303 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnfrsf4P47741 272 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxo40P62932 710 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pde12Q3TIU4 608 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700066B19RikQ3TS39 127 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dhrs11Q3U0B3 260 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Med22Q62276 200 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ugt2a2Q6PDD0 528 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr75Q6X632 540 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif2s1Q6ZWX6 315 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnk12Q76M80 430 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zc3hc1Q80YV2 501 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BC024139Q8BVJ3 772 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lgi4Q8K1S1 537 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr53Q8VGL8 312 aa19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acad8Q9D7B6 413 aa19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.8 ms