RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Defb34Q7TNV8 81 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr1251Q7TQZ3 318 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ankrd34cQ8BLB8 534 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Acsl5Q8JZR0 683 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Faim2Q8K097 317 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnf208Q8K0W3 265 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc25a42Q8R0Y8 318 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cacng6Q8VHW3 260 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cdca3Q99M54 266 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q9CWU4 180 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 EbplQ9D0P0 206 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dusp26Q9D700 211 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 March7Q9WV66 693 aa16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm21865A0A087WRL2 222 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 D7Ertd443eD2J0Y4 644 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nsmce4aG3XA30 381 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 NnmtO55239 264 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 P58686 83 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 TCAIMQ66JZ4 499 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr1161Q7TR29 321 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PigzQ8BTP0 560 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mpp7Q8BVD5 576 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc41a2Q8BYR8 573 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Glis1Q8K1M4 789 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tnfaip8l1Q8K288 186 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr54Q8VFE6 313 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Syt17Q920M7 470 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc35b3Q922Q5 369 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lims1Q99JW4 325 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tnfrsf12aQ9CR75 129 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 TheglQ9DA15 459 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slco2a1Q9EPT5 643 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Col5a3Q9JLI2 1739 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm10269G3UWD7 123 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm10715J3QP74 227 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sod3O09164 251 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Wsb2O54929 404 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ppm1aP49443 382 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CpeQ00493 476 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PrtgQ2EY15 1191 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MlipQ5FW52 269 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Diras2Q5PR73 199 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Spin1Q61142 262 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prr5Q812A5 387 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slco4c1Q8BGD4 722 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Frmd6Q8C0V9 622 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem30aQ8VEK0 364 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SmpxQ9DC77 85 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 M1apQ9Z0E1 529 aa16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 BC049352E9Q2Z6 85 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Scarb2O35114 478 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Grcc10O35127 126 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 C1dO35473 141 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 OsmrO70458 971 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Il1aP01582 270 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Epb42P49222 691 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 SnrpgP62309 76 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trim63Q38HM4 350 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prkg2Q61410 762 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AY358078Q6UY53 465 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Vwa2Q70UZ7 791 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arhgef4Q7TNR9 484 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr744Q7TRM0 323 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr366Q7TRY4 309 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem169Q8BG50 297 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Creg2Q8BGC9 288 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 C730034F03RikQ8BGL5 111 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ubqln1Q8R317 582 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Znrf4Q9DAH2 327 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Isoc2bQ9DCC7 210 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 OpcmlG5E8G3 345 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CaskO70589 926 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 LdhcP00342 332 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp28P10078 825 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abcb1aP21447 1276 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gabrb1P50571 474 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sf3b6P59708 125 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ctps1P70698 591 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Crtc2Q3U182 692 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dhrs9Q58NB6 319 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmem255bQ5FW56 369 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Bloc1s3Q5U5M8 195 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rxfp4Q7TQP4 414 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc6a17Q8BJI1 727 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Edem2Q8BJT9 577 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Bnc2Q8BMQ3 1127 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adamts4Q8BNJ2 833 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sirt4Q8R216 333 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adarb1Q91ZS8 711 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cmtm3Q99LJ5 184 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nol3Q9D1X0 220 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Spatc1lQ9D9W0 342 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 TrioQ0KL02 3102 aa16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pgbd5D3YZI9 523 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.5 ms