RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aqp8P56404 261 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rps25P62852 125 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cr1lQ64735 483 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bloc1s5Q8R015 185 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TapbplQ8VD31 451 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1093Q8VF14 322 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr693Q8VF89 316 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1052Q8VGR8 312 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hspb11Q9D6H2 143 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ift46Q9DB07 301 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sertad3Q9ERC3 197 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tp73Q9JJP2 631 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gde1Q9JL56 331 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Szt2A2A9C3 3431 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm6710A2ART0 554 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc16a3P57787 470 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr143P70259 405 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sdc3Q64519 442 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Megf11Q80T91 1091 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cxcl16Q8BSU2 246 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdlim5Q8CI51 591 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nmral1Q8K2T1 309 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr649Q8VGW1 312 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Odf4Q8VI88 290 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taldo1Q93092 337 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc7a9Q9QXA6 487 aa15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14459A2BI73 179 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20547B8JJN0 1276 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2-T24F8VQG4 363 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Galnt9G3X942 604 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FpgtG5E8F4 590 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ephb6O08644 1014 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CfbP04186 761 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alg8Q6P8H8 526 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dalrd3Q6PJN8 538 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc39a9Q8BFU1 308 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DpcdQ8BPA8 203 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc26a5Q99NH7 744 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrpl15Q9CPR5 295 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cmss1Q9CZT6 276 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcp10cE9Q046 482 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r111K7N674 857 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 F2rl3O88634 396 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Entpd7Q3TCT4 606 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itgb2lQ3UV74 738 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nr0b2Q62227 260 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cox14Q8BH51 57 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kiaa1671Q8BRV5 308 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Orai1Q8BWG9 304 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TtpaQ8BWP5 278 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pex5lQ8C437 567 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CipcQ8R0W1 432 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd276Q8VE98 316 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcf19Q99KJ5 263 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnmt3lQ9CWR8 421 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9CWU4 180 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Exo5Q9CXP9 373 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 9230112D13RikQ9D260 137 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phf6Q9D4J7 364 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mbd3l1Q9D9H3 186 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrelpQ9JK53 378 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Uba2Q9Z1F9 638 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adamts3E9Q287 1204 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc27a6E9Q9W4 619 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ubl4aP21126 157 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ctbp2P56546 445 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klf4Q60793 483 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas2r38Q7TQA6 331 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Faim2Q8K097 317 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wfikkn1Q8R0S6 552 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc107Q9DCC3 242 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phc2Q9QWH1 850 aa15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Irs2P81122 1321 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dmrtb1A2A9I7 359 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21904A8HG57 180 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr619E9PV95 320 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14139F6ZS36 494 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21866J3QMH4 180 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp934K7N6H3 473 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RngttO55236 597 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl7P14148 270 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map2k4P47809 397 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Crtc2Q3U182 692 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Irf4Q64287 450 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ces5aQ6AW46 575 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpp25Q91WE3 199 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ash2lQ91X20 623 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spz1Q99MY0 378 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psmg2Q9EST4 264 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm436B1AVU6 407 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OcmP51879 109 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taf1aP97357 453 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp41Q02526 198 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Defb48Q3UW22 87 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PdgfrlQ6PE55 375 aa15.22■□□□□ 0.03
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sra1Q80VJ2 232 aa15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.5 ms