RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM25	Q86YD3	366 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NAGS	Q8N159	534 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	POC1A	Q8NBT0	407 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR52N5	Q8NH56	324 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPATA18	Q8TC71	538 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZBTB9	Q96C00	473 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	LYZL4	Q96KX0	146 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	PANX3	Q96QZ0	392 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NDN	Q99608	321 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAP3K3	Q99759	626 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	MED10	Q9BTT4	135 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NACA2	Q9H009	215 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CHST11	Q9NPF2	352 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	KLK13	Q9UKR3	277 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGF2R	P11717	2491 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931		A8MXQ7	604 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	WASH3P	C4AMC7	463 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	COCH	O43405	550 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NTN1	O95631	604 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	GABRG2	P18507	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CASP1	P29466	404 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	P2RY2	P41231	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TNFRSF4	P43489	277 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR3A1	P47881	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CASP4	P49662	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	MYL6	P60660	151 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TNNC1	P63316	161 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	HERC3	Q15034	1050 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TAF13	Q15543	124 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	HFE	Q30201	348 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TTC27	Q6P3X3	843 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ACOT1	Q86TX2	421 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	WDR49	Q8IV35	697 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	LMO3	Q8TAP4	145 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	FBXO32	Q969P5	355 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	PKP4	Q99569	1192 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF559	Q9BR84	538 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	DEC1	Q9P2X7	70 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CHKB	Q9Y259	395 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZZEF1	O43149	2961 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATRX	P46100	2492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A0B4J203	849 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	VEGFD	O43915	354 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCDC130	P13994	396 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CMA1	P23946	247 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	GAS1	P54826	345 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	GCNT1	Q02742	428 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF33A	Q06730	810 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	CYP24A1	Q07973	514 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SQLE	Q14534	574 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	STK38	Q15208	465 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	LRRC38	Q5VT99	294 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SMARCA2-231	ENST00000634931	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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