RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	CXCL2	P19875	107 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	HNMT	P50135	292 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PRMT2	P55345	433 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	RAP2B	P61225	183 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	TAP2	Q03519	686 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	UBXN11	Q5T124	520 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	HECTD3	Q5T447	861 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PAQR7	Q86WK9	346 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	GPR26	Q8NDV2	337 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SGK3	Q96BR1	496 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATA2	Q9UM82	520 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A0U1RQF3	1178 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	RECQL4	O94761	1208 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CLDN9	O95484	217 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	HP	P00738	406 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	TFPI	P10646	304 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CPN1	P15169	458 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	EPB42	P16452	691 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	RHOQ	P17081	205 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SYN1	P17600	705 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	NPR2	P20594	1047 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	TACR1	P25103	407 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	GAS1	P54826	345 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CAV3	P56539	151 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	UGT8	Q16880	541 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	HBM	Q6B0K9	141 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ORAI1	Q96D31	301 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	RDH14	Q9HBH5	336 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	GPR160	Q9UJ42	338 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CPEB1-215	ENST00000617958	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	AGRP	O00253	132 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	PEX14	O75381	377 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	S100A11	P31949	105 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	RFC3	P40938	356 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	MTNR1B	P49286	362 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	GPR143	P51810	404 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	LILRA4	P59901	499 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	PLD1	Q13393	1074 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	MADCAM1	Q13477	382 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	GPNMB	Q14956	572 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	GRIN2C	Q14957	1233 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC157	Q569K6	752 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM17	Q86X19	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	OR52N1	Q8NH53	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	POF1B	Q8WVV4	589 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	P2RY12	Q9H244	342 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	GABRR3	A8MPY1	467 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	PDYN	P01213	254 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	GABRA1	P14867	456 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	AMD1	P17707	334 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CPEB1-215	ENST00000617958	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79

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