RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 TRIM24O15164 1050 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 DCXO43602 365 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 LDB2O43679 373 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 OR10H2O60403 315 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PRAMEF11O60813 436 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 STX11O75558 287 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PTTG1O95997 202 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 IFNA10P01566 189 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TPOP07202 933 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 ANXA5P08758 320 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 THBS4P35443 961 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 KLF10Q13118 480 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 MPPED2Q15777 294 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 MGAT5BQ3V5L5 792 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TECRLQ5HYJ1 363 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 STK40Q8N2I9 435 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 WBP1Q96G27 269 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 GHRLQ9UBU3 117 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 C3orf18Q9UK00 162 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TET1Q8NFU7 2136 aa7.23□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 A0A087WV62 115 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 OR14I1A6ND48 311 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SURF4O15260 269 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 ADAM12O43184 909 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 CIB2O75838 187 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 INHAP05111 366 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PEPDP12955 493 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 CTPS1P17812 591 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TACR2P21452 398 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 ACVRL1P37023 503 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 CAPGP40121 348 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 OR2B6P58173 313 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 MC1RQ01726 317 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 FGL1Q08830 312 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 MERTKQ12866 999 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 BFSP2Q13515 415 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TCTN1Q2MV58 587 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 CCDC103Q8IW40 242 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 NEK7Q8TDX7 302 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 NUDT11Q96G61 164 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 ZNF597Q96LX8 424 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 ZNF599Q96NL3 588 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 MRI1Q9BV20 369 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 KLHL31Q9H511 634 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 ACTL8Q9H568 366 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 HCSTQ9UBK5 93 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SCN5AQ14524 2016 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 ANKRD36A6QL64 1941 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 NEMP2A6NFY4 417 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SLC38A8A6NNN8 435 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SULT1C2O00338 296 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 DLGAP3O95886 979 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 C9P02748 559 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 F11P03951 625 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 RAF1P04049 648 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 NPSP0C0P6 89 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 PTNP21246 168 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 ADH6P28332 368 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 CCR6P51684 374 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 RAD23AP54725 363 aa7.22□□□□□ -1.25
HCG18-244ENST00000602516 SH3BP2P78314 561 aa7.22□□□□□ -1.25
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