RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589861.2

CSNK1G2-206, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

TSL 5

Gene CSNK1G2, Length 756 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-206ENST00000589861 SOX30O94993 753 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 IFNA2P01563 188 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 CCDC166P0CW27 439 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ZNF708P17019 499 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 KCNJ5P48544 419 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 AAGABQ6PD74 315 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 C22orf34Q6ZV56 151 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 RNF112Q9ULX5 631 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 RNF223E7ERA6 249 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 S100BP04271 92 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 CD1DP15813 335 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 NAGAP17050 411 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 CNTFP26441 200 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 SIRPAP78324 504 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 SNTA1Q13424 505 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 OR2A2Q6IF42 318 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 NUP54Q7Z3B4 507 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 SFXN2Q96NB2 322 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ELOVL5Q9NYP7 299 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 EHD3Q9NZN3 535 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 HEY2Q9UBP5 337 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PGRMC2O15173 223 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 BSGP35613 385 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PIK3CBP42338 1070 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ATP6V0D1P61421 351 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ANKRD34AQ69YU3 496 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 OMA1Q96E52 524 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PBKQ96KB5 322 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.49■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 SLC22A20A6NK97 555 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 UGT2B11O75310 529 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 GBAP04062 536 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 EPB42P16452 691 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PIK3R1P27986 724 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ARFIP1P53367 373 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 POU4F1Q01851 419 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PLCXD2Q0VAA5 305 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 VEZF1Q14119 521 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 OR7G1Q8NGA0 311 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 LRRC39Q96DD0 335 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ITPAQ9BY32 194 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 FBXL2Q9UKC9 423 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 A0A087X1B8 175 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PIAS1O75925 651 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 TP53P04637 393 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 S1PR1P21453 382 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 NT5EP21589 574 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 SRD5A2P31213 254 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PLCZ1Q86YW0 608 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 HIPK1Q86Z02 1210 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 CAVIN3Q969G5 261 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 OPTCQ9UBM4 332 aa20.47■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 K7EPI3 171 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 CGAP01215 116 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 IVDP26440 423 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 CDC25BP30305 580 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 CLEC12BQ2HXU8 276 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 BEX5Q5H9J7 111 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 CHMP1BQ7LBR1 199 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 NUDT13Q86X67 352 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ZNF610Q8N9Z0 462 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 FIG4Q92562 907 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 TSPAN17Q96FV3 270 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 DKKL1Q9UK85 242 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 ABCA1O95477 2261 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK1G2-206ENST00000589861 TMCC2O75069 709 aa20.45■□□□□ 0.86
CSNK1G2-206ENST00000589861 F12P00748 615 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CSNK1G2-206ENST00000589861 PLAUP00749 431 aa20.45■□□□□ 0.86
CSNK1G2-206ENST00000589861 THBDP07204 575 aa20.45■□□□□ 0.86
CSNK1G2-206ENST00000589861 XKP51811 444 aa20.45■□□□□ 0.86
CSNK1G2-206ENST00000589861 HMGCS1Q01581 520 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms