RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM13O60858 407 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SEC22BO75396 215 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CLPSP04118 112 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT17P0C025 328 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MPIP34949 423 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 DCTP40126 519 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MASP1P48740 699 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MAN2A2P49641 1150 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FBXW4P57775 412 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SLC18A2Q05940 514 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ART3Q13508 389 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TOMM20Q15388 145 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 LTB4RQ15722 352 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NNATQ16517 81 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NTRK2Q16620 822 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 LYPD8Q6UX82 237 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 LIX1Q8N485 282 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 APOPT1Q96IL0 206 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 RUBCNLQ9H714 662 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 HEY2Q9UBP5 337 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 B4GALT7Q9UBV7 327 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PRODH2Q9UF12 536 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PLLPQ9Y342 182 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SERTM1A2A2V5 107 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 AZIN1O14977 448 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 RGS14O43566 566 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 MGRN1O60291 552 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TRAPPC6AO75865 159 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PCSK2P16519 638 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 S1PR1P21453 382 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 GPX3P22352 226 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ABCD3P28288 659 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 HTR1EP28566 365 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH3A1P30838 453 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 KRT20P35900 424 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 GSTM5P46439 218 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 DCAF7P61962 342 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP2Q05923 314 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 RIPK1Q13546 671 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PCLAFQ15004 111 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 RPS6KA2Q15349 733 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 GXYLT1Q4G148 440 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TBCELQ5QJ74 424 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 NOXRED1Q6NXP6 359 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TRABD2AQ86V40 505 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 DDIASQ8IXT1 998 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SLC34A3Q8N130 599 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 BANPQ8N9N5 519 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 SPPL2AQ8TCT8 520 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 AGR3Q8TD06 166 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 KAT2AQ92830 837 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF681Q96N22 645 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-214ENST00000583153 ITPAQ9BY32 194 aa7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.1 ms