RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 P2RX6O15547 441 aa4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 VPS26AO75436 327 aa4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 RPN2P04844 631 aa4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 UMODP07911 640 aa4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 EPORP19235 508 aa4.49□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 IDUAP35475 653 aa4.49□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 SLC6A12P48065 614 aa4.49□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
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PRPF8-211ENST00000574728 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 TTLL9Q3SXZ7 439 aa4.48□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 CEP78Q5JTW2 689 aa4.48□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.48□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 FAM45BPQ6NSW5 357 aa4.48□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 AGTRAPQ6RW13 159 aa4.48□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa4.48□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM126BQ8IUX1 230 aa4.48□□□□□ -1.69
PRPF8-211ENST00000574728 PLD3Q8IV08 490 aa4.48□□□□□ -1.69
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