RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 EMC8O43402 210 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 INMTO95050 263 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 MFN2O95140 757 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 PGM3O95394 542 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF682O95780 498 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 HPRP00739 348 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 CST1P01037 141 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ALPLP05186 524 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 LYNP07948 512 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 FHP07954 510 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ALPPL2P10696 532 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 MYF5P13349 255 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 GLB1P16278 677 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 CDH3P22223 829 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 CPN2P22792 545 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 CD1CP29017 333 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 NTSP30990 170 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 CSF2RBP32927 897 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 MAP3K8P41279 467 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 GPR3P46089 330 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 CLCN2P51788 898 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ARSFP54793 590 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ITGA1P56199 1179 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 RP1P56715 2156 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 RAB38P57729 211 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 OR1D5P58170 312 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ADAMTS20P59510 1910 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SELENOWP63302 87 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 OLR1P78380 273 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 DAG1Q14118 895 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SPIDRQ14159 915 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 PDK3Q15120 406 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 LTB4RQ15722 352 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SLC36A3Q495N2 470 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 REEP3Q6NUK4 255 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 MED25Q71SY5 747 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 CARFQ8N187 725 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.12□□□□□ -1.43
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CAPN3-210ENST00000561817 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SAP25Q8TEE9 199 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 PIGKQ92643 395 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 RAB8BQ92930 207 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 MOAP1Q96BY2 351 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 TMEM19Q96HH6 336 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 BBS4Q96RK4 519 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 OR51I1Q9H343 314 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.12□□□□□ -1.43
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CAPN3-210ENST00000561817 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 FAM229AH3BQW9 127 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SGK494L7N484 410 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 TXNDC9O14530 226 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 SUV39H1O43463 412 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPN3-210ENST00000561817 CHST10O43529 356 aa6.11□□□□□ -1.43
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