RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1W2PQ72 361 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 NKX2-8O15522 239 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 PDPK1O15530 556 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CTNSO60931 367 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 IGKV3-11P04433 115 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 HBQ1P09105 142 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ITPKBP27987 946 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 HPCAL1P37235 193 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ASMTP46597 345 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 XKP51811 444 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 HSD17B7P56937 341 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 FUT5Q11128 374 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 HSPB3Q12988 150 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SLC13A2Q13183 592 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ATP1A4Q13733 1029 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SFT2D3Q587I9 215 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CPTPQ5TA50 214 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM107Q6UX40 140 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 RINLQ6ZS11 566 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 FAM13CQ8NE31 585 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF721Q8TF20 911 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC115Q96NT0 180 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 OR52E6Q96RD3 313 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 TM9SF2Q99805 663 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CENPKQ9BS16 269 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CRB3Q9BUF7 120 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 NUDT9Q9BW91 350 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CXorf21Q9HAI6 301 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 EHD3Q9NZN3 535 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 KCNE3Q9Y6H6 103 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-211ENST00000561438 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1W2PP18 115 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 UPK1AO00322 258 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 ADAM10O14672 748 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 MYO1DO94832 1006 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 UNC5CO95185 931 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 ATP1B1P05026 303 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 PTPN4P29074 926 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 MAP3K8P41279 467 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 KIR3DL1P43629 444 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 GATA4P43694 442 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 STT3AP46977 705 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 MAN2A2P49641 1150 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 CHAF1BQ13112 559 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 MRGPREQ86SM8 312 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 DPP10Q8N608 796 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 ESX1Q8N693 406 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 OR4K14Q8NGD5 310 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 FBXO30Q8TB52 745 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 STARD8Q92502 1023 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 TANKQ92844 425 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 MTERF3Q96E29 417 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 THSD1Q9NS62 852 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-211ENST00000561438 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms