RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ESYT2	A0FGR8	921 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMD11	O00231	422 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NBR2	O15453	112 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF13	O43567	381 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ZIC3	O60481	467 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CABYR	O75952	493 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT19	P08727	400 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNB1	P14635	433 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	UQCRB	P14927	111 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	HPGD	P15428	266 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF3	P17036	446 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GOT1	P17174	413 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	UQCRC2	P22695	453 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SFTPD	P35247	375 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	RORA	P35398	523 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGA	P37287	484 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	MNDA	P41218	407 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNG1	P51959	295 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CD81	P60033	236 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC61G	P60059	68 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBA1B	P68363	451 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKL1	Q00532	357 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SP3	Q02447	781 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR50	Q13585	617 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	HERC3	Q15034	1050 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC6	Q16204	474 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CTF1	Q16619	201 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKN3	Q16667	212 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ODF4	Q2M2E3	257 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	WLS	Q5T9L3	541 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC27	Q6P3X3	843 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00523	Q86TU6	105 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf64	Q86WR6	236 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CD302	Q8IX05	232 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	MMD2	Q8IY49	270 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52I2	Q8NH67	350 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5R1	Q8NH85	324 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GPX8	Q8TED1	209 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TCP11	Q8WWU5	503 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	HPDL	Q96IR7	371 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TGM7	Q96PF1	710 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	KXD1	Q9BQD3	176 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	IL22	Q9GZX6	179 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GAREM1	Q9H706	876 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT15	Q9NV35	164 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	MIOS	Q9NXC5	875 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	CD300A	Q9UGN4	299 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		2.51	□□□□□ -2.01
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		2.51	□□□□□ -2.01

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