RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	DCDC1	P59894	354 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CDK3	Q00526	305 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	IRF4	Q15306	451 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TMED2	Q15363	201 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	NUS1	Q96E22	293 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PGM2	Q96G03	612 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	COX14	Q96I36	57 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	RBBP8	Q99708	897 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	OLFM1	Q99784	485 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MYLK	Q15746	1914 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	FPGT	O14772	594 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SCAMP1	O15126	338 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	VILL	O15195	856 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SPAG7	O75391	227 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	JRK	O75564	520 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CDK14	O94921	469 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM16	O95361	564 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	OR2C1	O95371	312 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CLDN14	O95500	239 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MT-ND3	P03897	115 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	IVL	P07476	585 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MSH3	P20585	1137 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CD27	P26842	260 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CASP2	P42575	452 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	NSG1	P42857	185 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEA12	P43365	314 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINB9	P50453	376 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	CSRP3	P50461	194 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	PFN3	P60673	137 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	MYBPH	Q13203	477 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	NAB1	Q13506	487 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	ITIH4	Q14624	930 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	NFATC4	Q14934	902 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		4.22	□□□□□ -1.73
LINS1-210	ENST00000560934	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.22	□□□□□ -1.73

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