RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553024.1

PPP1CC-210, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 2,797 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-210ENST00000553024 TMEM80Q96HE8 168 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 LRR1Q96L50 414 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 BRD9Q9H8M2 597 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ASIC5Q9NY37 505 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 DEC1Q9P2X7 70 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 A0A075B6Q4 140 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 A0A0B4J203 849 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 GLOD5A6NK44 160 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 I3L521 148 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 CASKO14936 926 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 MYL12BO14950 172 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 PEX14O75381 377 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 SLC2A10O95528 541 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 CISD3P0C7P0 127 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 GJA4P35212 333 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ETV3P41162 512 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 XKP51811 444 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 HSPB3Q12988 150 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 VEZF1Q14119 521 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ZMYND11Q15326 602 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 FBXO43Q4G163 708 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 TMEM215Q68D42 235 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 VOPP1Q96AW1 172 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 MSANTD3Q96H12 275 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 CRELD1Q96HD1 420 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 PIP5K1AQ99755 562 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ZNF222Q9UK12 451 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 STUB1Q9UNE7 303 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ARID1AO14497 2285 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 A0A1W2PS29 197 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 HYKKA2RU49 373 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 FAM183AA6NL82 134 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 H3BUI4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 PI15O43692 258 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 IL3P08700 152 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 UBL4AP11441 157 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 HSD3B1P14060 373 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 CELP19835 753 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 PCGF2P35227 344 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 NSG1P42857 185 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 MAP2K3P46734 347 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 SOX9P48436 509 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 PRKAG1P54619 331 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 OLR1P78380 273 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 GINS1Q14691 196 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 SYPL1Q16563 259 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 MACC1Q6ZN28 852 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 AMER3Q8N944 861 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 HMGB4Q8WW32 186 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 MED30Q96HR3 178 aa6.63□□□□□ -1.35
PPP1CC-210ENST00000553024 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms