RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 PIK3CBP42338 1070 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 STARP49675 285 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 CLDN18P56856 261 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 SIRPAP78324 504 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 TTC27Q6P3X3 843 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 PLXDC2Q6UX71 529 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ZNF615Q8N8J6 731 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 PDPRQ8NCN5 879 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 OR7G3Q8NG95 312 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ANKRD49Q8WVL7 239 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 HGDQ93099 445 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 PIGQQ9BRB3 760 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 GALNT9Q9HCQ5 603 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 CD274Q9NZQ7 290 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 LPAR3Q9UBY5 353 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 LAMP3Q9UQV4 416 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ZNF175Q9Y473 711 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 WIF1Q9Y5W5 379 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 GPX3P22352 226 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 THBS2P35442 1172 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 PTGDSP41222 190 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 TAS2R39P59534 338 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ATP6V0D1P61421 351 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ZNF460Q14592 562 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 GRHL2Q6ISB3 625 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 WDSUB1Q8N9V3 476 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 TRIM58Q8NG06 486 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 OMA1Q96E52 524 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 CFAP36Q96G28 342 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 NODALQ96S42 347 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ASB4Q9Y574 426 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 A0A1W2PR48 441 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 C2orf72A6NCS6 295 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 GLOD5A6NK44 160 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 LINC01387J3KSC0 135 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 KLF4O43474 513 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 TNFRSF21O75509 655 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 AIFM1O95831 613 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 CGAP01215 116 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 CT62P0C5K7 136 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 FAM58BPP0C7Q3 252 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 FCGR2AP12318 317 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 EPB42P16452 691 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 NT5EP21589 574 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 CXCR5P32302 372 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 CYP1B1Q16678 543 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 FBXO48Q5FWF7 155 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ANKRD34AQ69YU3 496 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ADAM5Q6NVV9 412 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 NUDT13Q86X67 352 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 PDIK1LQ8N165 341 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ZNF610Q8N9Z0 462 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 OR4K14Q8NGD5 310 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 HUS1BQ8NHY5 278 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ESAMQ96AP7 390 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 LRRC39Q96DD0 335 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 TSPAN17Q96FV3 270 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 PLPPR2Q96GM1 343 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 CD244Q9BZW8 370 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 OR10A4Q9H209 315 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 RNF122Q9H9V4 155 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 TMEM160Q9NX00 188 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 ZANQ9Y493 2812 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 SONP18583 2426 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 A0A0A6YYD5 115 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 GOLGA6L10A6NI86 522 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 OR6C70A6NIJ9 312 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 EFCAB8A8MWE9 144 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 OVOL3O00110 214 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 DLX3O60479 287 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 UGT2B11O75310 529 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 BANF1O75531 89 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 FESP07332 822 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 EPORP19235 508 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-228ENST00000551473 CNTFP26441 200 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms