RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CES1P1Q9UKY3 287 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SSR3Q9UNL2 185 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SPACA6W5XKT8 324 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 A0A0G2JN53 185 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TMEM129A0AVI4 362 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PRSS38A1L453 326 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 HYKKA2RU49 373 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TNFRSF10CO14798 259 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 DSCR3O14972 297 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PROM1O43490 865 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 KIAA0513O60268 411 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CSO75390 466 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CYP7B1O75881 506 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SOX30O94993 753 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 OR5F1O95221 314 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SOX14O95416 240 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ASGR2P07307 311 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ACP2P11117 423 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 MYOGP15173 224 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TNNI3P19429 210 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CERS1P27544 350 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PRKAG1P54619 331 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CDK5Q00535 292 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TNFRSF17Q02223 184 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 GINS1Q14691 196 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 INAVAQ3KP66 663 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CDC73Q6P1J9 531 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SLC27A4Q6P1M0 643 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TMEM107Q6UX40 140 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 IQCHQ86VS3 1027 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ATCAYQ86WG3 371 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CACUL1Q86Y37 369 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 NANOGP1Q8N7R0 232 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SETD6Q8TBK2 473 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TMEM163Q8TC26 289 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 LCN9Q8WX39 176 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 RSC1A1Q92681 617 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 OSTF1Q92882 214 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ELP4Q96EB1 424 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CHFRQ96EP1 664 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 WDR92Q96MX6 357 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 OR5M11Q96RB7 305 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 COQ7Q99807 217 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 NEURL2Q9BR09 285 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CENPOQ9BU64 300 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 AICDAQ9GZX7 198 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 KLHL31Q9H511 634 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 FAM170BA6NMN3 283 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 FAM227AF5H4B4 570 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 M0R129 80 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 STK25O00506 426 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 B3GALT2O43825 422 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SEMA7AO75326 666 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 UBXN7O94888 489 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 AK1P00568 194 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 HMGN1P05114 100 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 THBS1P07996 1170 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 HOXB2P14652 356 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 MMP11P24347 488 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms