RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	CHEK1	O14757	476 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SIGLEC5	O15389	551 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CLDN3	O15551	220 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	BUB3	O43684	328 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	APBB3	O95704	486 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	EML2	O95834	649 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CLPTM1	O96005	669 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CD48	P09326	243 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	IL4R	P24394	825 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP2F1	P24903	491 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	HLA-F	P30511	346 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ADSS	P30520	456 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PRDX2	P32119	198 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	XG	P55808	180 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ERVFC1-1	P60608	527 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MYBPC1	Q00872	1141 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SNX1	Q13596	522 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RAPSN	Q13702	412 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GTDC1	Q4AE62	458 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MPPE1	Q53F39	396 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ARSK	Q6UWY0	536 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF573	Q86YE8	665 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	LACC1	Q8IV20	430 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	DCLK2	Q8N568	766 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	BCORP1	Q8N888	145 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	BANP	Q8N9N5	519 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM58	Q8NG06	486 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PHYHIP	Q92561	330 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FCGR1B	Q92637	280 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM45B	Q96B21	275 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	OMA1	Q96E52	524 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	GIMAP5	Q96F15	307 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PCED1B	Q96HM7	432 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	S100A14	Q9HCY8	104 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	HPS4	Q9NQG7	708 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	THEG	Q9P2T0	379 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PR80	420 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CLRN2	A0PK11	232 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF195	O14628	629 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ANGPT2	O15123	496 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	FGF17	O60258	216 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CAVIN2	O95810	425 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT6B	P04259	564 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RALA	P11233	206 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT13	P13646	458 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP11B1	P15538	503 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC6A8	P48029	635 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT6C	P48668	564 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	OVGP1	Q12889	678 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX35	Q5T0J7	233 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	IL23R	Q5VWK5	629 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	RTL6	Q6ICC9	239 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6ZVQ6	151 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CUZD1	Q86UP6	607 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ITIH5	Q86UX2	942 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ELMOD1	Q8N336	334 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	PARP8	Q8N3A8	854 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	CERS5	Q8N5B7	392 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	SUSD6	Q92537	303 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	MCHR2	Q969V1	340 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	AZIN2	Q96A70	460 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ERP44	Q9BS26	406 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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