RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 PQLC3Q8N755 202 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SPATA18Q8TC71 538 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CNBD2Q96M20 576 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 MCEEQ96PE7 176 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 MS4A10Q96PG2 267 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 OR52B2Q96RD2 323 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SLC29A1Q99808 456 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CPNE1Q99829 537 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ZNF670Q9BS34 389 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 C1orf50Q9BV19 199 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 COG4Q9H9E3 785 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 NANOGQ9H9S0 305 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 EFCAB1Q9HAE3 211 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CXorf21Q9HAI6 301 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 FBXO8Q9NRD0 319 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 MIOSQ9NXC5 875 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 HAO2Q9NYQ3 351 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 RHCGQ9UBD6 479 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ABCD2Q9UBJ2 740 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 POLLQ9UGP5 575 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 IFT52Q9Y366 437 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CPQQ9Y646 472 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PTPRJQ12913 1337 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.65□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SCN5AQ14524 2016 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TRBC2A0A5B9 178 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 KPNA7A9QM74 516 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PLOD2O00469 737 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PFDN6O15212 129 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ACOX3O15254 700 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 XRCC3O43542 346 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SYNGR3O43761 229 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 UGT1A9O60656 530 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 KLHL41O60662 606 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PIAS1O75925 651 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CLPXO76031 633 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 UFL1O94874 794 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 VAPBO95292 243 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CALCAP01258 141 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 LIPFP07098 398 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 KRT19P08727 400 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 KRT3P12035 628 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 HSD17B1P14061 328 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PGAM1P18669 254 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 UGT1A6P19224 532 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 UGT1A4P22310 534 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 DNASE1P24855 282 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PSMA2P25787 234 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 MIPP30301 263 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 UGT1A3P35503 534 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 UGT1A5P35504 534 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 NR2C2P49116 596 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CCR3P51677 355 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 LIMK2P53671 638 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 DNAJB13P59910 316 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 BASP1P80723 227 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 MERTKQ12866 999 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 PRKAA1Q13131 559 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 MAPRE2Q15555 327 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ATP6AP1Q15904 470 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 UGCGQ16739 394 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 RGS21Q2M5E4 152 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 BOLA3Q53S33 107 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 COQ5Q5HYK3 327 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SPANXN3Q5MJ09 141 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 LCN8Q6JVE9 175 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 DCUN1D2Q6PH85 259 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TMEM270Q6UE05 265 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ZYG11AQ6WRX3 759 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CAMKMTQ7Z624 323 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TMEM135Q86UB9 458 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ITIH5Q86UX2 942 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 SNX32Q86XE0 403 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 WDR49Q8IV35 697 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ZNF595Q8IYB9 648 aa4.64□□□□□ -1.67
TRDN-204ENST00000542443 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms