RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 RIT1Q92963 219 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 TGIF2Q9GZN2 237 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 VN1R1Q9GZP7 353 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MMACHCQ9Y4U1 282 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DHRS12A0PJE2 317 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 TNFSF15O95150 251 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SNCBQ16143 134 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SYPL1Q16563 259 aa20.48■□□□□ 0.87
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PACSIN3-209ENST00000532457 BHLHB9Q6PI77 547 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 AMER2Q8N7J2 671 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC16A11Q8NCK7 471 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC35A4Q96G79 324 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 DGAT2Q96PD7 388 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 OR7D2Q96RA2 312 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 A4GALTQ9NPC4 353 aa20.48■□□□□ 0.87
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PACSIN3-209ENST00000532457 GMNNO75496 209 aa20.47■□□□□ 0.87
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PACSIN3-209ENST00000532457 RTP5Q14D33 572 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.47■□□□□ 0.87
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PACSIN3-209ENST00000532457 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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PACSIN3-209ENST00000532457 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 AURKCQ9UQB9 309 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 CACNA1AO00555 2505 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.46■□□□□ 0.87
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PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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PACSIN3-209ENST00000532457 SEPHS2Q99611 448 aa20.46■□□□□ 0.87
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PACSIN3-209ENST00000532457 SLC34A1Q06495 639 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 SERTAD2Q14140 314 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 OR52R1Q8NGF1 315 aa20.46■□□□□ 0.87
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PACSIN3-209ENST00000532457 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 PKP2Q99959 881 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-209ENST00000532457 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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PACSIN3-209ENST00000532457 BCHEP06276 602 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 ACP2P11117 423 aa20.45■□□□□ 0.86
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PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC80Q76M96 950 aa20.45■□□□□ 0.86
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PACSIN3-209ENST00000532457 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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PACSIN3-209ENST00000532457 ULBP3Q9BZM4 244 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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PACSIN3-209ENST00000532457 OLAHQ9NV23 265 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 M0QX08 132 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 TIPRLO75663 272 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 SLITRK5O94991 958 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 MT-ND1P03886 318 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 IFI6P09912 130 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 UMPSP11172 480 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP3K8P41279 467 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 KHKP50053 298 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-209ENST00000532457 EMDP50402 254 aa20.44■□□□□ 0.86
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