RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514271.2

CLIP1-205, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLIP1, Length 3,493 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-205ENST00000514271 GANCQ8TET4 914 aa6.99□□□□□ -1.29
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CLIP1-205ENST00000514271 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.99□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.99□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 U3KQ87 197 aa6.99□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 A8MXK9 166 aa6.99□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 GFYI3L273 518 aa6.99□□□□□ -1.29
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CLIP1-205ENST00000514271 M0R3H8 397 aa6.98□□□□□ -1.29
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CLIP1-205ENST00000514271 B4GALNT1Q00973 533 aa6.98□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 ITKQ08881 620 aa6.98□□□□□ -1.29
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CLIP1-205ENST00000514271 SNTA1Q13424 505 aa6.98□□□□□ -1.29
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CLIP1-205ENST00000514271 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
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CLIP1-205ENST00000514271 MYOCQ99972 504 aa6.98□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 COPS4Q9BT78 406 aa6.98□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.98□□□□□ -1.29
CLIP1-205ENST00000514271 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.98□□□□□ -1.29
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