RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		9.87	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	HRK	O00198	91 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CRLF1	O75462	422 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC4	O95801	387 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNA2	P01563	188 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	HPN	P05981	417 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT15	P19012	456 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS6KA2	Q15349	733 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NTRK2	Q16620	822 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM64	Q6YI46	380 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	UCN3	Q969E3	161 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MED18	Q9BUE0	208 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGM	Q9H3S5	423 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	OARD1	Q9Y530	152 aa		9.86	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ARID1A	O14497	2285 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTL6A	O96019	429 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV3-11	P04433	115 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	GSN	P06396	782 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PCNA	P12004	261 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCR5	P32302	372 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA3	P43357	314 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NRG3	P56975	720 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXW4	P57775	412 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKL1	Q00532	357 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	BIK	Q13323	160 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	GAB1	Q13480	694 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	DCST1	Q5T197	706 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RIT1	Q92963	219 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NTNG2	Q96CW9	530 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CERS2	Q96G23	380 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS39	Q96JC1	886 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPK	Q9BS16	269 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX15	Q9NRS6	342 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		9.85	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C76	A6NM76	312 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RCBTB2	O95199	551 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A12	P48065	614 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ5	P48544	419 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PTH2R	P49190	550 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RAP1GDS1	P52306	607 aa		9.84	□□□□□ -0.83

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