RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ADAM19Q9H013 955 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 DSCAMO60469 2012 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SERTM1A2A2V5 107 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM114B3SHH9 223 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 H0YIG0 161 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 AZIN1O14977 448 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 NME2P1O60361 137 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RDH16O75452 317 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SCELO95171 688 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 GOSR1O95249 250 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SERPINE1P05121 402 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 FGF4P08620 206 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 UROSP10746 265 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 NME2P22392 152 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CERS1P27544 350 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HMOX2P30519 316 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SERPINB1P30740 379 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 UQCRC1P31930 480 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 BSGP35613 385 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SERPINB5P36952 375 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RFC3P40938 356 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 XCR1P46094 333 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SLC1A6P48664 564 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PLA2G16P53816 162 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TNK1Q13470 666 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CUL3Q13618 768 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RUNX2Q13950 521 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HERC3Q15034 1050 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 POU4F3Q15319 338 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 GXYLT1Q4G148 440 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SFT2D3Q587I9 215 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SGO1Q5FBB7 561 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ABHD13Q7L211 337 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 M1APQ8TC57 530 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 METTL6Q8TCB7 284 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 AGR3Q8TD06 166 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 REPS1Q96D71 796 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PERPQ96FX8 193 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ACPTQ9BZG2 426 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 BRF2Q9HAW0 419 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SNX6Q9UNH7 406 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0A6YYD5 115 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 URADA6NGE7 173 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 KLF11O14901 512 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CHST10O43529 356 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CD5LO43866 347 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 TMPRSS11DO60235 418 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 ULK1O75385 1050 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SLC25A12O75746 678 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 SEMA3DO95025 777 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 KRT6AP02538 564 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 KRT6BP04259 564 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HSD3B1P14060 373 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf135-204ENST00000495399 GRK2P25098 689 aa6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms