RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494810.1

PDCD6IP-215, Transcript of programmed cell death 6 interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD6IP, Length 619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6IP-215ENST00000494810 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
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PDCD6IP-215ENST00000494810 DGAT2Q96PD7 388 aa5.7□□□□□ -1.5
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PDCD6IP-215ENST00000494810 CENPKQ9BS16 269 aa5.7□□□□□ -1.5
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PDCD6IP-215ENST00000494810 HERVK_113P63132 956 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 ERVK-8P63133 956 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDCD6IP-215ENST00000494810 SLC15A4Q8N697 577 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDCD6IP-215ENST00000494810 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDCD6IP-215ENST00000494810 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PDCD6IP-215ENST00000494810 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 PNPLA3Q9NST1 481 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 ZNF225Q9UK10 706 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 TMCO1Q9UM00 188 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 ERVK-19Q9WJR5 959 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 RNF6Q9Y252 685 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDCD6IP-215ENST00000494810 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa5.68□□□□□ -1.5
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