RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487288.1

TAF6-215, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 6, human

TSL 5

Gene TAF6, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF6-215	ENST00000487288	EHD3	Q9NZN3	535 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	XPR1	Q9UBH6	696 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FETUB	Q9UGM5	382 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MED12	Q93074	2177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ABCA4	P78363	2273 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SNPH	O15079	494 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	UGT2B11	O75310	529 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CBX7	O95931	251 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ATP1B1	P05026	303 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NAGA	P17050	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TSPAN8	P19075	237 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CNTF	P26441	200 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MAPK12	P53778	367 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ADAM8	P78325	824 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	OMA1	Q96E52	524 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	LRRC46	Q96FV0	321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SERHL	Q9NQF3	203 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	AHSP	Q9NZD4	102 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF225	Q9UK10	706 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PLLP	Q9Y342	182 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MPDZ	O75970	2070 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288		A0A1W2PPR1	153 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	C1orf226	A1L170	272 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ATE1	O95260	518 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ACTL6A	O96019	429 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PDYN	P01213	254 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	RBP1	P09455	135 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SBK3	P0C264	359 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	KRT15	P19012	456 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CASQ1	P31415	396 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	OPRM1	P35372	400 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	EMD	P50402	254 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	DGKQ	P52824	942 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CDH13	P55290	713 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	IFT88	Q13099	833 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24	3e-8	■■□□□ 11.8
TAF6-215	ENST00000487288	LTB4R	Q15722	352 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF681	Q96N22	645 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	DOCK7	Q96N67	2140 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	HBEGF	Q99075	208 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FUT8	Q9BYC5	575 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
TAF6-215	ENST00000487288	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288		B4DXG7	233 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	IL18BP	O95998	194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	CPN1	P15169	458 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	PCSK2	P16519	638 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	SORD	Q00796	357 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TAF6-215	ENST00000487288	KIF18B	Q86Y91	864 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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