RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR4L1Q8NH43 312 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PANX3Q96QZ0 392 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CHP1Q99653 195 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FOXC2Q99958 501 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CARD6Q9BX69 1037 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A0U1RQJ8 604 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1W2PPV9 198 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBE2CO00762 179 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADAM10O14672 748 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 LDLRAD4O15165 306 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FOXS1O43638 330 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC25A12O75746 678 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TJP3O95049 919 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 METTL18O95568 372 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTGER1P34995 402 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 RFC3P40938 356 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 XCR1P46094 333 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCP4P48539 62 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 AGTR2P50052 363 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 UFM1P61960 85 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PMPCAQ10713 525 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 NSDHLQ15738 373 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SFT2D3Q587I9 215 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCTD11Q693B1 232 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 LINC00523Q86TU6 105 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLD3Q8IV08 490 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SIAH3Q8IW03 269 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 M1APQ8TC57 530 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMPDL3AQ92484 453 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRT35Q92764 455 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SCMH1Q96GD3 660 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 LPAR4Q99677 370 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 THAP1Q9NVV9 213 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAC3Q9UHF0 121 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNF6Q9Y252 685 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 HS6ST1O60243 411 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 NDUFS3O75489 264 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 NEURL1O76050 574 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TOXO94900 526 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 HSPA4LO95757 839 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 IL1RNP18510 177 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNASE1P24855 282 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAGEA1P43355 309 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYB561P49447 251 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 TTPAP49638 278 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 EFNA3P52797 238 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR4D2P58180 307 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 LTBQ06643 244 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDH17Q12864 832 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTK6Q13882 451 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM53BQ14153 422 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEMA3AQ14563 771 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 MED22Q15528 200 aa6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms