RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PPICP45877 212 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 DNASE1L1P49184 302 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NRG3P56975 720 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 FBXW4P57775 412 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 DCAF7P61962 342 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 FOXO1Q12778 655 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NNATQ16517 81 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 FAM47EQ6ZV65 393 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PRR22Q8IZ63 422 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 FBXW8Q8N3Y1 598 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 LIX1Q8N485 282 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 FNDC5Q8NAU1 212 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 FAM13CQ8NE31 585 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PPCDCQ96CD2 204 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 HSPBAP1Q96EW2 488 aa19.28■□□□□ 0.68
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ACTB-211ENST00000480301 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
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ACTB-211ENST00000480301 PPP1R36Q96LQ0 422 aa19.27■□□□□ 0.68
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ACTB-211ENST00000480301 FOLH1BQ9HBA9 442 aa19.27■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
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ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1HQ9UI12 483 aa19.27■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
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ACTB-211ENST00000480301 CAPN14A8MX76 684 aa19.26■□□□□ 0.67
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ACTB-211ENST00000480301 C4orf17Q53FE4 359 aa19.26■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 CT45A2Q5DJT8 189 aa19.26■□□□□ 0.67
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
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ACTB-211ENST00000480301 SPPL2AQ8TCT8 520 aa19.26■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa19.26■□□□□ 0.67
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ACTB-211ENST00000480301 AKTIPQ9H8T0 292 aa19.26■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 IL1RL2Q9HB29 575 aa19.26■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 THAP1Q9NVV9 213 aa19.26■□□□□ 0.67
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ACTB-211ENST00000480301 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa19.26■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD33BA6NCL7 494 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 TP53I11O14683 189 aa19.25■□□□□ 0.67
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ACTB-211ENST00000480301 LRRTM2O43300 516 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 PPM1BO75688 479 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 PSMG1O95456 288 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 RNF224P0DH78 156 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 TMED10P49755 219 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 CORO7P57737 925 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 PPIAP62937 165 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 PLGLB1Q02325 96 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 HYAL4Q2M3T9 481 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 SMU1Q2TAY7 513 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 NPSR1Q6W5P4 371 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 FGD2Q7Z6J4 655 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa19.25■□□□□ 0.67
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