RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480058.5

PRPF4B-205, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF4B, Length 6,775 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-205ENST00000480058 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 CHRDL2Q6WN34 429 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 METTL4Q8N3J2 472 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 OR8J2Q8NGG1 315 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 OR52N1Q8NH53 320 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 SFXN5Q8TD22 340 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 LRRC15Q8TF66 581 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 NT5C3BQ969T7 300 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TMEM185BQ9H7F4 350 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 EMC7Q9NPA0 242 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 DIRAS1O95057 198 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ACRV1P26436 265 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 DUSP7Q16829 419 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 PLK5Q496M5 336 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF805Q5CZA5 627 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 AWAT2Q6E213 333 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 NIPAL3Q6P499 406 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 SERINC5Q86VE9 423 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 OR5D16Q8NGK9 328 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 FANK1Q8TC84 345 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ZFP90Q8TF47 636 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF583Q96ND8 569 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ACSS2Q9NR19 701 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 THSD1Q9NS62 852 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 MSRAQ9UJ68 235 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 SLC6A5Q9Y345 797 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 USP2O75604 605 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 SOX14O95416 240 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 PDGFAP04085 211 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ASGR2P07307 311 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 MAP2K4P45985 399 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 SLC6A8P48029 635 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 MTNR1BP49286 362 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 RIDAP52758 137 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 FAPQ12884 760 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 PEA15Q15121 130 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 AADACL4Q5VUY2 407 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 PXKQ7Z7A4 578 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 KCNA7Q96RP8 456 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 CD300AQ9UGN4 299 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 EMCNQ9ULC0 261 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 DHDHQ9UQ10 334 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TMEM129A0AVI4 362 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 E7EQ34 232 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TOR1AO14656 332 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 RAB3DO95716 219 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 CPNE6O95741 557 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 CSTAP01040 98 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 CRABP1P29762 137 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ETV1P50549 477 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 PSPHP78330 225 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TSPAN31Q12999 210 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 RAB11BQ15907 218 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TATDN3Q17R31 274 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 VITQ6UXI7 678 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ARL14Q8N4G2 192 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 B3GNT7Q8NFL0 401 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF566Q969W8 418 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 DGAT2Q96PD7 388 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 MAP10Q9P2G4 905 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 KIF1AQ12756 1690 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 F5H5P2 479 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 H0YIV9 168 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 KIAA0355O15063 1070 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 ANKRD28O15084 1053 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 VILLO15195 856 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 GPR39O43194 453 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 TFP02787 698 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-205ENST00000480058 SOD2P04179 222 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms