RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 DOCK7Q96N67 2140 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 A0A1B0GVC2 190 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 C1orf226A1L170 272 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SERTM1A2A2V5 107 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 C2orf72A6NCS6 295 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 OR6C76A6NM76 312 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ULK1O75385 1050 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CRCPO75575 148 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 COX6B1P14854 86 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SERPINB3P29508 390 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ALDH3A1P30838 453 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TRPC1P48995 793 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NUDCD3Q8IVD9 361 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 DIO2Q92813 273 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ZNF681Q96N22 645 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 EBPLQ9BY08 206 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SLC6A15Q9H2J7 730 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 LDAHQ9H6V9 325 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CHST11Q9NPF2 352 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ALKBH4Q9NXW9 302 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa11.95□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 AKAP9Q99996 3911 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SPG11Q96JI7 2443 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CBX7O95931 251 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CHEK2O96017 543 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 IL3P08700 152 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 PCSK2P16519 638 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GPX3P22352 226 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GRK2P25098 689 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SERPINB4P48594 390 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP10-9P60411 292 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 MAP4K2Q12851 820 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 HHATQ5VTY9 493 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 PAOXQ6QHF9 649 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 RNF165Q6ZSG1 346 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 MED12LQ86YW9 2145 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TAGAPQ8N103 731 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TP53INP1Q96A56 240 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 KLHL29Q96CT2 875 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GNRHR2Q96P88 292 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ITPAQ9BY32 194 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 EXO5Q9H790 373 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 MID1IP1Q9NPA3 183 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ZFP64Q9NPA5 681 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 PFDN4Q9NQP4 134 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 EHD3Q9NZN3 535 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CNIH4Q9P003 139 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ZNF639Q9UID6 485 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 FAM215AQ9Y5M1 114 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 AKAP6Q13023 2319 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TMEM114B3SHH9 223 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 AQP7O14520 342 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 PCDH7O60245 1069 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GUCY1B2O75343 617 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ATP1B1P05026 303 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 DHRS4L1P0CG22 281 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GLI4P10075 376 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 UROSP10746 265 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CREB1P16220 341 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ACVR2AP27037 513 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ABCD3P28288 659 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 MAN2A2P49641 1150 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 WNT3P56703 355 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 LIX1LQ8IVB5 337 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 OR7G1Q8NGA0 311 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 OR52R1Q8NGF1 315 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms