RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	GDF1	P27539	372 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	GPC1	P35052	558 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	MGAT2	Q10469	447 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	NTRK2	Q16620	822 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM198	Q66K66	360 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM107	Q6UX40	140 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	LIX1	Q8N485	282 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T11	Q8NH01	316 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	OMA1	Q96E52	524 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	EGLN2	Q96KS0	407 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF597	Q96LX8	424 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS44	E7EML9	344 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TYROBP	O43914	113 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PEX11A	O75192	247 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	REM1	O75628	298 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	CELA3A	P09093	270 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TACR1	P25103	407 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ABCD3	P28288	659 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	MC3R	P41968	323 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINB4	P48594	390 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TRPC1	P48995	793 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	MAN2A2	P49641	1150 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SMS	P52788	366 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	DUSP8	Q13202	625 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SLC10A1	Q14973	349 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	CROCCP2	Q86T23	111 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	EID3	Q8N140	333 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	RILP	Q96NA2	401 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ITPR2	Q14571	2701 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	GNB5	O14775	395 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PDPK1	O15530	556 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	COQ9	O75208	318 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	IL12B	P29460	328 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	DCAF7	P61962	342 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	NOTCH2	Q04721	2471 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	HSPB3	Q12988	150 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	DESI1	Q6ICB0	168 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZSR9	355 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	OR7G2	Q8NG99	324 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF675	Q8TD23	568 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF639	Q9UID6	485 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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