RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 ITGA1P56199 1179 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP3R1P63098 170 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 VLDLRP98155 873 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MAP4K2Q12851 820 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 DPYSL3Q14195 570 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC32Q14392 662 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MBTPS1Q14703 1052 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 RSU1Q15404 277 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM198Q66K66 360 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 AHSA2Q719I0 299 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CEP97Q8IW35 865 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM110BQ8TC76 370 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MR1Q95460 341 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PYCR2Q96C36 320 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ORAI1Q96D31 301 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 OR1F2PQ96R84 312 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MRI1Q9BV20 369 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ASPNQ9BXN1 380 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 OR51E2Q9H255 320 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 BRF2Q9HAW0 419 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CALML5Q9NZT1 146 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 BRCA2P51587 3418 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM238C9JI98 176 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TPP1O14773 563 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 FFAR3O14843 346 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 NPC1O15118 1278 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ARPC5O15511 151 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR42O15529 346 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 STBD1O95210 358 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 STAG3L3P0CL85 134 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 BMP7P18075 431 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CD58P19256 250 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 DTYMKP23919 212 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ARRB2P32121 409 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 THBS2P35442 1172 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PIGAP37287 484 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PPT1P50897 306 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 TAS2R40P59535 323 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 RAP1BP61224 184 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 PICALMQ13492 652 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 HAGHQ16775 308 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 DCAF10Q5QP82 559 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 LIPMQ5VYY2 423 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ULK3Q6PHR2 472 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 LAX1Q8IWV1 398 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 NETO2Q8NC67 525 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4K15Q8NH41 348 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 MFSD3Q96ES6 412 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 RAD9AQ99638 391 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 EGFL8Q99944 293 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 ALG8Q9BVK2 526 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 GREM2Q9H772 168 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
RABGGTB-208ENST00000471759 OXSMQ9NWU1 459 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms