RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469534.1

ITGA6-208, Transcript of integrin subunit alpha 6, human

TSL 2

Gene ITGA6, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA6-208	ENST00000469534	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	KNTC1	P50748	2209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534		H0Y3Z8	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534		H0YIG0	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	PLD2	O14939	933 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	GSTA4	O15217	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	KCNK5	O95279	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	BMP10	O95393	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	GPR75	O95800	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	OPN1SW	P03999	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	HEXB	P07686	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CELA2A	P08217	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	OR12D1	P0DN82	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	UQCRC2	P22695	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ME2	P23368	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	OTX2	P32243	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	TRPC1	P48995	793 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	MNAT1	P51948	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CORO7	P57737	925 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	C21orf58	P58505	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	OCA2	Q04671	838 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	DUSP8	Q13202	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms