RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	HIPK4	Q8NE63	616 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ART5	Q96L15	291 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PIGU	Q9H490	435 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PISD	Q9UG56	409 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CFL2	Q9Y281	166 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAMTS20	P59510	1910 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	IDS	B3KWA1	339 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529		C9J4A7	227 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	GSTA4	O15217	222 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ALOX12B	O75342	701 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ENTPD5	O75356	428 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	NKX2-2	O95096	273 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	AK1	P00568	194 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	GPI	P06744	558 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	HEXB	P07686	556 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	NUDT7	P0C024	238 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	C1QTNF9	P0C862	333 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PSPH	P78330	225 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CDK6	Q00534	326 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	NCF4	Q15080	339 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	REEP3	Q6NUK4	255 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ESX1	Q8N693	406 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PMEPA1	Q969W9	287 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	LRGUK	Q96M69	825 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF145	Q96MT1	663 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR87	Q9BY21	358 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51I1	Q9H343	314 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CALML5	Q9NZT1	146 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PRODH2	Q9UF12	536 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	USP22	Q9UPT9	525 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SATB2	Q9UPW6	733 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0G2JPF8	293 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2W5	A6NFC9	320 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	OR6C76	A6NM76	312 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529		A8MUI8	341 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	C17orf105	B2RV13	164 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	PRAMEF2	O60811	474 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	DDAH2	O95865	285 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNA14	P01570	189 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNA16	P05015	189 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	TNNI3	P19429	210 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP6V1B2	P21281	511 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC7A1	P30825	629 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC5A2	P31639	672 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CLCN2	P51788	898 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	DCAF7	P61962	342 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	DUSP8	Q13202	625 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SCARB2	Q14108	478 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	MLIP	Q5VWP3	458 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	CBLL1	Q75N03	491 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAF4-208	ENST00000469529	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.87	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms