RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 ICAM2P13598 275 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 CDH12P55289 794 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 SEMA3AQ14563 771 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 SMU1Q2TAY7 513 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 GTDC1Q4AE62 458 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 CLEC14AQ86T13 490 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 KRT73Q86Y46 540 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 FUNDC1Q8IVP5 155 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 OR4F6Q8NGB9 312 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 TMEM203Q969S6 136 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 TUBA1CQ9BQE3 449 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 SSR2P43308 183 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 PLGLB1Q02325 96 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 CHAF1BQ13112 559 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 DDI2Q5TDH0 399 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 AGTRAPQ6RW13 159 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 PLET1Q6UQ28 207 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 TCAIMQ8N3R3 496 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 TTLQ8NG68 377 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 DEFB126Q9BYW3 111 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 C1orf109Q9NX04 203 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 STMN3Q9NZ72 180 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 COPS7AQ9UBW8 275 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 ATP6V1HQ9UI12 483 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 A8MUA0 341 aa5.65□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 STATHP02808 62 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 ST6GAL1P15907 406 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 GSTM2P28161 218 aa5.65□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.65□□□□□ -1.5
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SHQ1-205ENST00000468371 LUZP2Q86TE4 346 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 EPHX4Q8IUS5 362 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 KCNJ9Q92806 393 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 Q96MT0 163 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 QRFPRQ96P65 431 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 DSN1Q9H410 356 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 APMAPQ9HDC9 416 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 DNAJC11Q9NVH1 559 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 CLN6Q9NWW5 311 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-205ENST00000468371 NEU3Q9UQ49 428 aa5.65□□□□□ -1.5
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