RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460616.5

SSR4-206, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,482 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-206ENST00000460616 NXPE2Q96DL1 559 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 NLNQ9BYT8 704 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 GSX2Q9BZM3 304 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 GPR37L1O60883 481 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 GBAP04062 536 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 HLA-DPB1P04440 258 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 OPRD1P41143 372 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 MC1RQ01726 317 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 BCL2L1Q07817 233 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 PUDPQ08623 228 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CAMK2DQ13557 499 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 NTRK2Q16620 822 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 DUSP6Q16828 381 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 DEF8Q6ZN54 512 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CHST9Q7L1S5 443 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CHFRQ96EP1 664 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 RNF32Q9H0A6 362 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 MAB21L2Q9Y586 359 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CACNG2Q9Y698 323 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.64□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 KLKB1P03952 638 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SOX18P35713 384 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 DCDC1P59894 354 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 DSTNP60981 165 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SEMG2Q02383 582 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 INSL4Q14641 139 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 KRT74Q7RTS7 529 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 RIT1Q92963 219 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 PPCDCQ96CD2 204 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 KLHL15Q96M94 604 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 OR2M2Q96R28 347 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 A0A1W2PPL8 197 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 IRGMA1A4Y4 181 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 AGAP14A8MT82 685 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 C5orf58C9J3I9 102 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 K7ERQ8 282 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 GABRPO00591 440 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SLC16A5O15375 505 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 LIMS3P0CW19 117 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 LIMS4P0CW20 117 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 MPC1LP0DKB6 136 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 TFPIP10646 304 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 AHCYP23526 432 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 DNASE1P24855 282 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CD79BP40259 229 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SP140Q13342 867 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SHHQ15465 462 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 LIPIQ6XZB0 460 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SHFQ7M4L6 423 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 OR7G3Q8NG95 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 HGDQ93099 445 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 MED8Q96G25 268 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 A0A1W2PRG6 482 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 MTMR11A4FU01 709 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 H3BUI4 141 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 PPM1BO75688 479 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 LALBAP00709 142 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 OR12D1P0DN82 309 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 MYOGP15173 224 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 CELP19835 753 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 GKP32189 559 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 BMP8BP34820 402 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 BTCP35070 178 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-206ENST00000460616 MTNR1AP48039 350 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms