RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456161.5

PCBP1-AS1-238, PCBP1 antisense RNA 1, human

TSL 3

Gene PCBP1-AS1, Length 880 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	SIX2	Q9NPC8	291 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	FGF21	Q9NSA1	209 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	RMND1	Q9NWS8	449 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	AFF2	P51816	1311 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	GSAP	A4D1B5	854 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	HIP1	O00291	1037 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ARPC2	O15144	300 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ATP6V0E1	O15342	81 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	GMFG	O60234	142 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	KRT8	P05787	483 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	PLA2G4B	P0C869	781 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ERVK-10	P10266	1014 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ATP6V1C1	P21283	382 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	CALB2	P22676	271 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	CD27	P26842	260 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	PCK1	P35558	622 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	PPP1R2	P41236	205 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	CDKN1B	P46527	198 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ATP12A	P54707	1039 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	DLK1	P80370	383 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	GCNT1	Q02742	428 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	GPR17	Q13304	367 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	RCN2	Q14257	317 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	DMC1	Q14565	340 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	PHKG1	Q16816	387 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	AKAP14	Q86UN6	197 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ANKFN1	Q8N957	763 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	OR52N5	Q8NH56	324 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	SEPT8	Q92599	483 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	HES6	Q96HZ4	224 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	NDN	Q99608	321 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	CENPK	Q9BS16	269 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	NUP58	Q9BVL2	599 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	EXO5	Q9H790	373 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	C8orf4	Q9NR00	106 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	RNF14	Q9UBS8	474 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	LRRC42	Q9Y546	428 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ABCC12	Q96J65	1359 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161		A0A0G2JLW4	131 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	C5orf51	A6NDU8	294 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ZNF716	A6NP11	495 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	IQCF5	A8MTL0	148 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	TRAPPC3	O43617	180 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	CRCP	O75575	148 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	MOCS3	O95396	460 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	PAEP	P09466	180 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	HOXB7	P09629	217 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ZNF735	P0CB33	412 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	CLU	P10909	449 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	RRM2	P31350	389 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	TIMP3	P35625	211 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	HSD17B3	P37058	310 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ETV5	P41161	510 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	NAGLU	P54802	743 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	RAPSN	Q13702	412 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ZMYND11	Q15326	602 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ALX1	Q15699	326 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	KLHL22	Q53GT1	634 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-238	ENST00000456161	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		5.29	□□□□□ -1.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms