RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448136.5

SNHG16-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNHG16, Length 3,607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-201ENST00000448136 LHX3Q9UBR4 397 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 IRAK3Q9Y616 596 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 MGAT4DA6NG13 374 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 H7C0S8 307 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 FZD6O60353 706 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 B4GALT2O60909 372 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 IL1AP01583 271 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 RGS4P49798 205 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 IRF8Q02556 426 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 KLBQ86Z14 1044 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 C12orf57Q99622 126 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 TMEM245Q9H330 911 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 FANCFQ9NPI8 374 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 M0R3H8 397 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GPR171O14626 319 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 KDELR3O43731 214 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PRPS2P11908 318 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ACRV1P26436 265 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 HNF1BP35680 557 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 DGCR2P98153 550 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CDK6Q00534 326 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 Q6ZTK2 550 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ZFP82Q8N141 532 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 FGF11Q92914 225 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ZNF98A6NK75 572 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ATG12O94817 140 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ANXA5P08758 320 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PRPS1L1P21108 318 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PCGF2P35227 344 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 IRS1P35568 1242 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 HNMTP50135 292 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ZP1P60852 638 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GPR85P60893 370 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ABRQ12979 859 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 KCNC3Q14003 757 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SYT14P1Q58G82 188 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SCRN2Q96FV2 425 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 OR10A4Q9H209 315 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GPR160Q9UJ42 338 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PROM1O43490 865 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ZNF623O75123 536 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 DHFRP00374 187 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 HLA-DQB1P01920 261 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 BCHEP06276 602 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 RD3LP0DJH9 198 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SHC1P29353 583 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SLC6A1P30531 599 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SLC6A12P48065 614 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 B2MP61769 119 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SIAH3Q8IW03 269 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 BBS1Q8NFJ9 593 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 OR8K3Q8NH51 312 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 WDR48Q8TAF3 677 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 NXPE2Q96DL1 559 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 RNFT2Q96EX2 444 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SARGQ9BW04 601 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GHITMQ9H3K2 345 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms