RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 GREM1O60565 184 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SLC22A5O76082 557 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 OR7A10O76100 309 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 IRS1P35568 1242 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SPINT3P49223 89 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 C21orf58P58505 322 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SYPL1Q16563 259 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 UCN3Q969E3 161 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM159Q96B96 161 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 BRF2Q9HAW0 419 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 PROM1O43490 865 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 MTFR2Q6P444 385 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 FBXL6Q8N531 539 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM163Q8TC26 289 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CCL26Q9Y258 94 aa14.57□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF197O14709 1029 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SLC28A2O43868 658 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 RFPL3O75679 317 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 PER3P56645 1201 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TBPL1P62380 186 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 A0A0G2JN53 185 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 FAAHO00519 579 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CCL16O15467 120 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 UGDHO60701 494 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SLC43A1O75387 559 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TOXO94900 526 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CXCL3P19876 107 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 RPA4Q13156 261 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SP140Q13342 867 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 OCLNQ16625 522 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 HYLS1Q96M11 299 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.56□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 FRS3O43559 492 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 LIMS3P0CW19 117 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 LIMS4P0CW20 117 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TFPIP10646 304 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SMSP52788 366 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TEX261Q6UWH6 196 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF480Q8WV37 535 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 POF1BQ8WVV4 589 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 RNF32Q9H0A6 362 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 NUDT15Q9NV35 164 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CNIH4Q9P003 139 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 U3KQ87 197 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 TSPAN4O14817 238 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SLC16A5O15375 505 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CHP2O43745 196 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 B4GALT2O60909 372 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SOCS5O75159 536 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 LRG1P02750 347 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 CATP04040 527 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 PTGS2P35354 604 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SLC6A11P48066 632 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 SOX9P48436 509 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 PRKAG1P54619 331 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZVU0 165 aa14.55□□□□□ -0.08
SFRP4-201ENST00000436072 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms