RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 P04436 131 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFI6P09912 130 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF24P17028 368 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNLYP22749 145 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MEOX1P50221 254 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR85P60893 370 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FHL5Q5TD97 284 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LYPD8Q6UX82 237 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SULF2Q8IWU5 870 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NATD1Q8N6N6 113 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POGLUT1Q8NBL1 392 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM13CQ8NE31 585 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SACM1LQ9NTJ5 587 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa16.02■□□□□ 0.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.02■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKUB1A6NFN9 424 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FRG2CA6NGY1 282 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SDHDO14521 159 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACOX3O15254 700 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DRD5P21918 477 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPICP45877 212 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UQCRFS1P47985 274 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MANFP55145 182 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLDN8P56748 225 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSPHP78330 225 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPS6KA2Q15349 733 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NTRK2Q16620 822 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPTPQ5TA50 214 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OGFOD2Q6N063 350 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2L13Q8N349 312 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR7A2PQ8NGA2 310 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ELP4Q96EB1 424 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSPBAP1Q96EW2 488 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAGED4Q96JG8 741 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C7orf26Q96N11 449 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTBD9Q96Q07 612 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRK2Q5S007 2527 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UPK1AO00322 258 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TP53I11O14683 189 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERN1O75460 977 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CBX6O95503 412 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCL3P10147 92 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCD3P28288 659 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TDGF1P3P51864 188 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DIO3P55073 304 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C21orf58P58505 322 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPP38P78345 283 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLCXD2Q0VAA5 305 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC22A10Q63ZE4 541 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM64Q6YI46 380 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GK5Q6ZS86 529 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM47EQ6ZV65 393 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRR22Q8IZ63 422 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR10G3Q8NGC4 313 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR5M3Q8NGP4 307 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PAQR8Q8TEZ7 354 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VSTM2LQ96N03 204 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM173AQ9BQD7 235 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOLH1BQ9HBA9 442 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEPPQ9NTK1 212 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNIH4Q9P003 139 aa16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLEC18AA5D8T8 446 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 G3V3Y1 287 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACOT7O00154 380 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TO15178 435 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAMP1P11279 417 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAGAP17050 411 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNR1P21554 472 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MST1P26927 711 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EPHA3P29320 983 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXW4P57775 412 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MLC1Q15049 377 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLEC18BQ6UXF7 455 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPATA19Q7Z5L4 167 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIMKLAQ8IXN7 391 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC34A3Q8N130 599 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLEC18CQ8NCF0 446 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2M7Q8NG81 312 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms